Les médecins ont déclaré que le shampooing antipelliculaire a des effets secondaires négatifs sur le cuir chevelu car il contient certaines substances. Selon le Dr Alexandra Borrega, directrice générale du groupe d'entreprises NATURA Siberica, tous les shampooings antipelliculaires ne peuvent pas traiter les pellicules causées par l'un des champignons Malassezia. Elle dit : "Il existe des types de shampooings qui créent un film sur le cuir chevelu, ce qui empêche les pellicules de se former et de tomber. Mais cet effet disparaît lorsque ce shampooing n'est pas utilisé." Elle ajoute que le médicament antifongique triclosan, qui se trouve dans un certain nombre de shampooings antipelliculaires, a des propriétés destructrices du microbiome et affecte négativement le cuir chevelu. Pour sa part, le Dr Tatiana Kachanova, spécialiste de la greffe de cheveux à la clinique FUE, note que les sulfates, qui aident à décomposer les graisses et à rincer abondamment, peut avoir des effets négatifs tels qu'irriter la sensibilité de la peau et empêcher la brillance des cheveux. Elle ajoute que l'effet de ces types de shampooing commence après 2-3 minutes d'application sur les cheveux, après quoi il doit être rincé à l'eau tiède pour éviter l'irritation du cuir chevelu.